55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0909 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  74.88 
 
 		 215 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  48.54 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  47.57 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.15 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  26.39 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.64 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.05 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.65 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.19 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.68 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  22.79 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.98 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.61 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.77 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.23 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.8 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.79 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.89 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.88 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.34 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.73 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.48 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.18 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.37 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.79 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.94 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  26.9 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.36 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  21.84 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.73 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.67 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.91 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  28.3 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.62 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.63 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.28 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  22.66 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.63 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.83 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.14 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.25 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  22.17 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.71 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  26.04 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  22.17 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.63 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.11 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.06 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.49 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2233  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.09 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.88 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.12 
 
 		 226 aa  42  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.28 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>