52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0829 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  36.12 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.35 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.94 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.49 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.49 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.11 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.59 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.1 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.57 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.23 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.29 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.54 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.69 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.29 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  24.03 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  24.03 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.57 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  24.03 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.97 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.89 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.44 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.72 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.17 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.54 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.31 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.98 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.16 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.16 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.84 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.48 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.31 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.5 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.5 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.14 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  23.73 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.77 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  25.2 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.39 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.61 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  25.2 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  25.32 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.47 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.58 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  47.62 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  22.11 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.42 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0783  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.42 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  28 
 
 		 205 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>