30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1416 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  91.83 
 
 		 208 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  48.06 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  47.57 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.99 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.49 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.44 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.02 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.91 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  26.29 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.9 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.15 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.17 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.29 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.66 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.26 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.02 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.26 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  22.38 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  22.38 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  44.9 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.02 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  43.75 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.37 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  21.66 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.98 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  21.96 
 
 		 216 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  26.7 
 
 		 205 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0783  CRISPR-associated CT1974 family protein  39.66 
 
 		 243 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  25 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>