48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1587 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.95 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.19 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.18 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.68 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.81 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  32.52 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.71 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.18 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.27 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.12 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.33 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.32 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.37 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.04 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  27.7 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.29 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.09 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.79 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.34 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.38 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.76 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.32 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  23.35 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.76 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.79 
 
 		 229 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.36 
 
 		 230 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.82 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.32 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.65 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.22 
 
 		 215 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.66 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.29 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.94 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.29 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.22 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.04 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.47 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.14 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.46 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.71 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.9 
 
 		 243 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.1 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  20.81 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.45 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  51.35 
 
 		 241 aa  40.8  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  23.72 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>