31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0485 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0485  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.363464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0783  CRISPR-associated protein, Cse3 family  43.72 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0783  CRISPR-associated CT1974 family protein  41.3 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2233  CRISPR-associated protein, Cse3 family  35.27 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0931  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.06 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3219  CRISPR-associated protein  36.09 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0346  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.58 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.27 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.92 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.11 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.45 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.99 
 
 		 215 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  28.14 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.32 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.92 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.86 
 
 		 216 aa  45.4  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.86 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.86 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.19 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  24.32 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  23.77 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.97 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.52 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  47.37 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.19 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.52 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  23.77 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.43 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  43.33 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  40.91 
 
 		 206 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>