29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3826 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0493  MSHA pilin protein MshD  98.15 
 
 		 184 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0090654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  87.22 
 
 		 184 aa  315  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0518  methylation site containing protein  86.74 
 
 		 192 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  84.66 
 
 		 188 aa  294  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  79.1 
 
 		 191 aa  284  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  78.09 
 
 		 191 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0570  methylation site containing protein  76.92 
 
 		 182 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  80.59 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3338  MSHA pilin protein MshD  69.32 
 
 		 184 aa  249  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0330251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3742  methylation site containing protein  73.17 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  68.42 
 
 		 184 aa  235  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  64.94 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  62.57 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3758  methylation site containing protein  61.8 
 
 		 191 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0114484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0463  MSHA pilin protein MshD  63.86 
 
 		 175 aa  207  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.959402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  37.16 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  30.88 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  33.33 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002379  MSHA pilin protein MshD  30.9 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0479  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHD)  28.43 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2829  MSHA pilin protein MshD  40.19 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.720742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  28.92 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  33.08 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  29.24 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  27.37 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  26.54 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  43.75 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>