28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3758 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3758  methylation site containing protein  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0114484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  72.88 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  66.3 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0570  methylation site containing protein  63.1 
 
 		 182 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 183 aa  239  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  63.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  63.33 
 
 		 192 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0518  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 192 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  61.54 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  62.22 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0493  MSHA pilin protein MshD  61.54 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0090654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  62.36 
 
 		 188 aa  220  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  61.8 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3338  MSHA pilin protein MshD  60.11 
 
 		 184 aa  214  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0330251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3742  methylation site containing protein  57.22 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0463  MSHA pilin protein MshD  56 
 
 		 175 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.959402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  36.36 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  36.04 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  29.7 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0479  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHD)  28.57 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  30.81 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2829  MSHA pilin protein MshD  29.53 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.720742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002379  MSHA pilin protein MshD  29.74 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  26.92 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  26.55 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  23.03 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  21.24 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>