29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4103 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  100 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  82.14 
 
 		 191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  80.61 
 
 		 191 aa  320  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0493  MSHA pilin protein MshD  80.85 
 
 		 184 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0090654  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  80.61 
 
 		 192 aa  308  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  78.72 
 
 		 184 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0518  methylation site containing protein  76.53 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  84.66 
 
 		 176 aa  294  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0570  methylation site containing protein  75.26 
 
 		 182 aa  287  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3338  MSHA pilin protein MshD  73.78 
 
 		 184 aa  260  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0330251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  70.93 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3742  methylation site containing protein  68.48 
 
 		 178 aa  234  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 183 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  63.89 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3758  methylation site containing protein  62.36 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0114484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0463  MSHA pilin protein MshD  65.64 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.959402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  35.03 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  33.33 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  31.28 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  29.95 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0479  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHD)  28.95 
 
 		 197 aa  87.8  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002379  MSHA pilin protein MshD  29.05 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2829  MSHA pilin protein MshD  40.91 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.720742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  28.65 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  26.63 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  28.22 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  24.86 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160212  normal  0.808354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>