29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0570 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0570  methylation site containing protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  77.89 
 
 		 184 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0493  MSHA pilin protein MshD  76.32 
 
 		 184 aa  290  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0090654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  76.17 
 
 		 191 aa  288  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  75.26 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0518  methylation site containing protein  74.48 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  74.74 
 
 		 192 aa  283  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  74.09 
 
 		 191 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  76.92 
 
 		 176 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3338  MSHA pilin protein MshD  72.62 
 
 		 184 aa  261  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0330251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3742  methylation site containing protein  68.36 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  70.45 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3758  methylation site containing protein  63.1 
 
 		 191 aa  240  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0114484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  62.5 
 
 		 198 aa  223  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  64 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0463  MSHA pilin protein MshD  65.27 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.959402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  37.57 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  30.94 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002379  MSHA pilin protein MshD  31.35 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  28.88 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  28.5 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2829  MSHA pilin protein MshD  28.19 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.720742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0479  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHD)  27.6 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  28.8 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  26.14 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  23.12 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  27.81 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  41.94 
 
 		 527 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>