27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002379 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002379  MSHA pilin protein MshD  100 
 
 		 187 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  53.51 
 
 		 191 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0479  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHD)  34.18 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3742  methylation site containing protein  32.09 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  31.35 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0493  MSHA pilin protein MshD  31.55 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0090654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  31.31 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0570  methylation site containing protein  31.35 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  30.9 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  29.05 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3338  MSHA pilin protein MshD  30 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0330251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3758  methylation site containing protein  29.74 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0114484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0518  methylation site containing protein  30.53 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  29.32 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  29.41 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  28.8 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2829  MSHA pilin protein MshD  31.96 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.720742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  28.34 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  30.81 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  36.21 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  34.75 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0463  MSHA pilin protein MshD  30.43 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.959402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  30.48 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  24.59 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  24.29 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  22.28 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>