26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0475 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  97.92 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  95.83 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0518  methylation site containing protein  85.94 
 
 		 192 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  81.12 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0493  MSHA pilin protein MshD  80.73 
 
 		 184 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0090654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  79.69 
 
 		 184 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0570  methylation site containing protein  74.74 
 
 		 182 aa  287  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  76.92 
 
 		 176 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3338  MSHA pilin protein MshD  68.25 
 
 		 184 aa  262  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0330251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  68.54 
 
 		 184 aa  244  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  64.74 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3742  methylation site containing protein  63.54 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3758  methylation site containing protein  62.5 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0114484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  62.37 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0463  MSHA pilin protein MshD  63.01 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.959402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  32.83 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  34.43 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  32.14 
 
 		 191 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  31.44 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0479  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHD)  27.18 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002379  MSHA pilin protein MshD  29.47 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2829  MSHA pilin protein MshD  37.07 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.720742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  32.86 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  28.25 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  23.84 
 
 		 163 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>