More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1028 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 
317 aa  626  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  41.61 
 
 
311 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  38.49 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  38.49 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  41.05 
 
 
289 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  36.48 
 
 
320 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
312 aa  226  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
324 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  37.01 
 
 
313 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  40.91 
 
 
320 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
320 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
320 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
320 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.11 
 
 
336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  38.55 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  38.18 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  38.55 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  36.62 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  35.82 
 
 
337 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  36.62 
 
 
338 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  37.14 
 
 
313 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  36.43 
 
 
313 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
338 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  36.07 
 
 
313 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  37.67 
 
 
335 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  36.88 
 
 
336 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  36.6 
 
 
314 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 
280 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
282 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
313 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  37.91 
 
 
331 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
280 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  37.8 
 
 
318 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  34.39 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  38.15 
 
 
349 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  35.76 
 
 
320 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  37.5 
 
 
325 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.42 
 
 
352 aa  198  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  35.37 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.23 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  35.11 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  38.18 
 
 
319 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  38.18 
 
 
319 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
319 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  37.92 
 
 
346 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.66 
 
 
339 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  38.75 
 
 
325 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  40.73 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  38.22 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  40.96 
 
 
319 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.22 
 
 
332 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  40.15 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  39.78 
 
 
315 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  34.18 
 
 
352 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  34.87 
 
 
344 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  35.88 
 
 
325 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.66 
 
 
274 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  33.33 
 
 
368 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  35.79 
 
 
328 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  29.07 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  27.7 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  27.27 
 
 
340 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  28.52 
 
 
351 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  26.81 
 
 
356 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  29.07 
 
 
349 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  26.58 
 
 
359 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  25.34 
 
 
355 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  25.61 
 
 
334 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  25.61 
 
 
334 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  27.01 
 
 
350 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  25.18 
 
 
352 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 
351 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  26.24 
 
 
351 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  30.1 
 
 
336 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  26.25 
 
 
344 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  29.17 
 
 
329 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  26.24 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  26.24 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 
351 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 
351 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  25.32 
 
 
335 aa  99.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  28.72 
 
 
326 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  29.08 
 
 
326 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  26.33 
 
 
344 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  29.08 
 
 
326 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  29.08 
 
 
326 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  29.08 
 
 
326 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  26.93 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  26.76 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  24.75 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  26.41 
 
 
335 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  28.67 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  26.41 
 
 
335 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  26.41 
 
 
335 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>