More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2662 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  100 
 
 
336 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  84.73 
 
 
337 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  83.54 
 
 
338 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  83.03 
 
 
338 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  83.33 
 
 
338 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  84.16 
 
 
338 aa  531  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  82.12 
 
 
338 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  82.32 
 
 
338 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  83.54 
 
 
334 aa  524  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  85.2 
 
 
280 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  84.59 
 
 
282 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  85.87 
 
 
280 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  63.64 
 
 
336 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  62.46 
 
 
320 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  56.73 
 
 
352 aa  349  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  56.31 
 
 
339 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  59.18 
 
 
332 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  57.86 
 
 
325 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  47.76 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  46.79 
 
 
319 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  46.79 
 
 
319 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 
319 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  43.96 
 
 
320 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  47.3 
 
 
319 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  43.62 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  43.62 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  50 
 
 
319 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  42.42 
 
 
335 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  42.07 
 
 
346 aa  249  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
312 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  41.96 
 
 
349 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.82 
 
 
336 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 
318 aa  236  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
322 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
322 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  43.81 
 
 
328 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  41.23 
 
 
318 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  38.44 
 
 
311 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  38.3 
 
 
289 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  35.71 
 
 
323 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  35.71 
 
 
323 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 
320 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  37.68 
 
 
320 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  40 
 
 
325 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  40.14 
 
 
344 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  40.42 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  38.46 
 
 
368 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  38.52 
 
 
321 aa  209  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  34.81 
 
 
313 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  38.33 
 
 
331 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  34.44 
 
 
313 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  34.44 
 
 
313 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  36.9 
 
 
314 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  40 
 
 
325 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  33.81 
 
 
313 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.78 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  32.92 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  35.07 
 
 
352 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  40.86 
 
 
274 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  36.47 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  36.09 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 
351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  27.62 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  27.62 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  27.62 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  27.62 
 
 
351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  27.62 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  27.55 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.05 
 
 
335 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  27.55 
 
 
351 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  27.55 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  25.83 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  25.83 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 
335 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  26.62 
 
 
335 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  26.62 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 
335 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 
337 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  27.09 
 
 
337 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  28.57 
 
 
350 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  28.39 
 
 
366 aa  105  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  32.01 
 
 
315 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  27.99 
 
 
324 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  26.51 
 
 
351 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  26.81 
 
 
336 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  27.99 
 
 
333 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  29.21 
 
 
324 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  29.68 
 
 
352 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  31.34 
 
 
326 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  29.34 
 
 
375 aa  99.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  30.99 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  30.99 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  30.99 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  30.99 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>