More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0731 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  100 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  44.2 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  46.44 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  46.44 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  47.02 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  42.76 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  46.1 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  44.41 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.14 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  44.52 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  44.52 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  44.52 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  42.05 
 
 		 289 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  41.9 
 
 		 311 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  41.47 
 
 		 335 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  45.76 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  43.63 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  41.28 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  40.72 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  41.28 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  41.91 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  41.28 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  41.47 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  38.41 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  39.4 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  42.96 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  42.96 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  42.96 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  39.08 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  41.72 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.48 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  43.14 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  38.8 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.48 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  37.68 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  42.81 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  36.84 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  38.94 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 		 338 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.19 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  36.69 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  36.97 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  39.33 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  37.32 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  39.66 
 
 		 352 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  37.32 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  36.49 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  39.87 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.59 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  40 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  37.46 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  39.48 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  38.65 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  39.11 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.52 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  34.03 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  33.73 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  34.17 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  33.13 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  33.13 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  33.53 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  30.72 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  29.81 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  29.81 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  29.47 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  28.84 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  30.82 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.2 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  31.49 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  28.62 
 
 		 349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  30.17 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  28.77 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  28.83 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  29.29 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.82 
 
 		 694 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  28.43 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  29.43 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  28.2 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  28.85 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  31.1 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  30.22 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  29.41 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>