More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3470 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  100 
 
 
313 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  99.36 
 
 
313 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  97.44 
 
 
313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  62.21 
 
 
313 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  62.76 
 
 
313 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  58.61 
 
 
314 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.09 
 
 
322 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
322 aa  275  5e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
312 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  41.28 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  40 
 
 
289 aa  241  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  38.38 
 
 
335 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  40.67 
 
 
311 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  41.75 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  39.2 
 
 
346 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.33 
 
 
336 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  38.14 
 
 
323 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  38.14 
 
 
323 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  38.69 
 
 
321 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  43.53 
 
 
320 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  43.53 
 
 
320 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.78 
 
 
352 aa  232  7.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  39.2 
 
 
318 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 
318 aa  229  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
324 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  40.96 
 
 
349 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  36.12 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  36.12 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  39.71 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  36.98 
 
 
338 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  36.98 
 
 
334 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  35.59 
 
 
325 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
338 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
280 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  36.67 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.56 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.6 
 
 
338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  40.8 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  36.3 
 
 
338 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
282 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
338 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.64 
 
 
336 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  34.81 
 
 
336 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  39.04 
 
 
344 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  34.81 
 
 
337 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  36.58 
 
 
322 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.43 
 
 
317 aa  203  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  36.33 
 
 
319 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  35.69 
 
 
278 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  36.93 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  38.02 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  36.4 
 
 
352 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  34.83 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  35.03 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  39.04 
 
 
368 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.98 
 
 
332 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  40.86 
 
 
315 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  36.15 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  41.27 
 
 
274 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  40.47 
 
 
315 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.47 
 
 
694 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  30.4 
 
 
335 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.93 
 
 
335 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
335 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
335 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.93 
 
 
335 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  30.25 
 
 
315 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
335 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  27.15 
 
 
375 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  29.58 
 
 
335 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  27.95 
 
 
350 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  27.18 
 
 
356 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
335 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  29.58 
 
 
335 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
335 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  29.58 
 
 
335 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  26.83 
 
 
336 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  26.98 
 
 
342 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  28.16 
 
 
354 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 
356 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.03 
 
 
678 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.69 
 
 
678 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.03 
 
 
678 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  27.18 
 
 
348 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.03 
 
 
678 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  28.82 
 
 
348 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.03 
 
 
678 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  27.53 
 
 
348 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 
343 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.03 
 
 
678 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  28.46 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  27.4 
 
 
349 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.69 
 
 
678 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  29.17 
 
 
362 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  29.24 
 
 
358 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  29.03 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>