More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1000 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  100 
 
 
312 aa  611  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  74.6 
 
 
311 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  76.41 
 
 
289 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  44.92 
 
 
320 aa  291  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  43.53 
 
 
322 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
322 aa  285  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.71 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  47.67 
 
 
335 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  47.92 
 
 
331 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  44.07 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  44.07 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
320 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  44.98 
 
 
346 aa  265  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  40.65 
 
 
313 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
320 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
320 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  43.87 
 
 
324 aa  261  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  45.07 
 
 
320 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  41.56 
 
 
321 aa  256  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  39.02 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.64 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  39.41 
 
 
313 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38.36 
 
 
313 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  41.99 
 
 
319 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
319 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  41.99 
 
 
319 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
313 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  37.1 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.47 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  44.78 
 
 
344 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  43.04 
 
 
318 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  39.6 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  37.58 
 
 
338 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  37.58 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  38.59 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  38.29 
 
 
278 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  38.01 
 
 
334 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  38.01 
 
 
338 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.75 
 
 
338 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  43.3 
 
 
344 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  39.53 
 
 
325 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 
282 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
338 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  39.07 
 
 
349 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 
280 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 
318 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  40.57 
 
 
320 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  41.33 
 
 
319 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.13 
 
 
339 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  41.86 
 
 
319 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  42.07 
 
 
328 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 
280 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.7 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  38.67 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.8 
 
 
332 aa  211  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  35.39 
 
 
322 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  39.18 
 
 
352 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  40.49 
 
 
368 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  38.03 
 
 
325 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 
315 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  42.25 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  40 
 
 
315 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  29.39 
 
 
335 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.19 
 
 
335 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.19 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 
335 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  27.27 
 
 
356 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  28.81 
 
 
344 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  29.19 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  28.09 
 
 
375 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  27.78 
 
 
348 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  29.43 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  28.86 
 
 
335 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  28.86 
 
 
335 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  28.15 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  27.78 
 
 
348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  29.19 
 
 
349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  27.18 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  28.48 
 
 
340 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  29.31 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  30.5 
 
 
354 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  28.86 
 
 
348 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  26.25 
 
 
336 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  29.79 
 
 
315 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  30.38 
 
 
358 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  28.53 
 
 
347 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  26.51 
 
 
359 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  25.33 
 
 
354 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  27.3 
 
 
330 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.67 
 
 
694 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  29.11 
 
 
357 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  27.39 
 
 
315 aa  105  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.76 
 
 
664 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  26.83 
 
 
357 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  26.69 
 
 
346 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>