More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2403 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  100 
 
 		 328 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  63.12 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  63.12 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  61.79 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  61.33 
 
 		 335 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  63.52 
 
 		 318 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  61.03 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  61.46 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  54.68 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  51.42 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  51.42 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  51.42 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  53.95 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  50.84 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  54.14 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  53.02 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  55.03 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  54.29 
 
 		 319 aa  298  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  56.06 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  53.64 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  52.2 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  52.01 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  48.84 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  44.67 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  44.7 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  43.85 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  42.86 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  44.33 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  44.52 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  44.52 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  55.94 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  43.96 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  47.63 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  44.18 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  46.32 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  41.84 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  46.13 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  40.66 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  45.76 
 
 		 280 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  40.33 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  48.7 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  39.73 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  39.73 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  45.63 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  54.55 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  49.68 
 
 		 332 aa  245  6e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  40.67 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  40.67 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  55.59 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  40.07 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  40.3 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  40.86 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  44.18 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  57.59 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  41.61 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  40 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.88 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.27 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  29.97 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  29.97 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.97 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  32.86 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.62 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  29.62 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  34.37 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  34.73 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  30.18 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  30.18 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  28.71 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  30.22 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  34.98 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  30.54 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  31.21 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  29.17 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  29.28 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  28.43 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  28.43 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  33.1 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  30.26 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  33.46 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  28.41 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  33.46 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  33.46 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  32.88 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  31.65 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 		 678 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  28.7 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>