More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0400 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 324 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  80.27 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  80.27 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  47.5 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  47.5 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  48.11 
 
 		 278 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  46.03 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  47.81 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  44.98 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  42.95 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  42.76 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  41.42 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.61 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  42.51 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  42.86 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  44.12 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  41.56 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  41.56 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.47 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  43.29 
 
 		 318 aa  248  9e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  42.37 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  38.67 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.42 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  38.67 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  39.87 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  40.92 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  39.5 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  38.67 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.54 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  42.01 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  38.59 
 
 		 336 aa  235  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  42.45 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  41.72 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  39.67 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  36.96 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  35.88 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.79 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  36.58 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  36.58 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 282 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 		 280 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  36.9 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  36.9 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  39.87 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  41.64 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.27 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  41.1 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  41.18 
 
 		 352 aa  215  7e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  38.08 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  38.6 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.91 
 
 		 274 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  28.19 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  28.05 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  29.31 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.29 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.29 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  28.22 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  29.24 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  29.24 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  27.64 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  27.11 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  28.67 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  27.64 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  27.09 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  27.97 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  28.24 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  29.32 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  27.33 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  27.33 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  26.3 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.45 
 
 		 678 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  26.85 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.79 
 
 		 678 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.45 
 
 		 678 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.45 
 
 		 678 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.45 
 
 		 678 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.79 
 
 		 678 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>