More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1931 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  100 
 
 
321 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  47.87 
 
 
320 aa  299  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.73 
 
 
322 aa  289  4e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 
322 aa  288  7e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  42.86 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  42.86 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 
312 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
324 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  41.28 
 
 
320 aa  257  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  42.38 
 
 
335 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  47.68 
 
 
320 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
320 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
320 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  45.25 
 
 
346 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  44.34 
 
 
318 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43 
 
 
336 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  43.09 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  39.74 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  38.69 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  42.96 
 
 
331 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  42.09 
 
 
289 aa  242  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  38.36 
 
 
313 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38.36 
 
 
313 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  42.33 
 
 
349 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  38.89 
 
 
322 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  41.28 
 
 
313 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  38.02 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  43.09 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.6 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  43.09 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  43.09 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  39.93 
 
 
314 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  41.45 
 
 
325 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  38.91 
 
 
278 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  43.23 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  37.87 
 
 
337 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  37.21 
 
 
338 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  42.77 
 
 
319 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 
282 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  37.21 
 
 
338 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.03 
 
 
336 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
338 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
280 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  39.26 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  39.26 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  42.34 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  39.26 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.83 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  39.26 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  38.52 
 
 
336 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 
280 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.29 
 
 
318 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.53 
 
 
332 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  40.48 
 
 
344 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.11 
 
 
317 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  35.35 
 
 
320 aa  202  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  41.61 
 
 
328 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  36.43 
 
 
352 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 
315 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  41.18 
 
 
325 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  37.28 
 
 
368 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  39.24 
 
 
315 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  42.25 
 
 
274 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  25.87 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 
335 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  27.09 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  26.54 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  27.72 
 
 
335 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  27.72 
 
 
335 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 
335 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 
335 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  25.89 
 
 
335 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  27.52 
 
 
350 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  26.79 
 
 
319 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
351 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  25.39 
 
 
336 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 
351 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  25.74 
 
 
351 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  25.74 
 
 
351 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 
351 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  26.07 
 
 
323 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  26.62 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  26.62 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  26.62 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  25.55 
 
 
351 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  28.03 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  29.18 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 
351 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 
351 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  29.11 
 
 
323 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  24.31 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  29.18 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  26.74 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  27.15 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  26.96 
 
 
347 aa  95.9  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  26.03 
 
 
336 aa  95.9  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  29.81 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  28.16 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0698736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>