More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3343 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  99.36 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  97.44 
 
 		 313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  62.21 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  63.1 
 
 		 313 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  58.61 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  43.13 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  41.28 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  40 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  40.67 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  38.05 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  42.12 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.78 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  38.36 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  38.87 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  37.46 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  37.46 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  38.87 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  40.61 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  38 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  35.79 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  35.79 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  36.6 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  36.6 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  36.3 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  35.25 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  39.11 
 
 		 331 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  40.8 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.19 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  35.93 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.64 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  34.44 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  39.04 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  34.44 
 
 		 337 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.07 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  36.24 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  36.33 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  36.93 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  36.3 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  36.04 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  35.05 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  35.29 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  34.74 
 
 		 325 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  39.04 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  40.86 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.6 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  36.15 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  41.27 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  40.47 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.39 
 
 		 694 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  30.19 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  30.82 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  30.82 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  30.63 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  26.8 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  30.47 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  30.47 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  29.71 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  26.83 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  26.62 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  28.82 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  29 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  26.52 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  27.18 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  27.33 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  27.53 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.07 
 
 		 678 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.07 
 
 		 678 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.07 
 
 		 678 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.71 
 
 		 678 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.07 
 
 		 678 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.07 
 
 		 678 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  29.17 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  31.7 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  27.4 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.71 
 
 		 678 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  27.92 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  28.63 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  28.83 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  27.78 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>