More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0299 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  100 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  62.38 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  62.38 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  61.39 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  61.41 
 
 		 335 aa  342  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  63.52 
 
 		 328 aa  321  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  58.03 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  55.87 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  54.3 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  57.84 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  50.51 
 
 		 318 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  54 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  58.27 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  53.79 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  46.79 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  46.79 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  46.98 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  54.73 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  47.3 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.1 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  43.3 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  44.34 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  39.4 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.82 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  41.61 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  41.47 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  38.05 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  38.05 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  41.61 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  41.58 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  39.2 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  45.69 
 
 		 368 aa  245  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  41.75 
 
 		 336 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  42.42 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  47.78 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  53.87 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38.87 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 338 aa  241  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  38.54 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  41.1 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  41.1 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  45.56 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  40.94 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  37.99 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  52.82 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  39.79 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  44.13 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  57.98 
 
 		 274 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  40 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  37.66 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  50.18 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.8 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.78 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  31.25 
 
 		 359 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  32.79 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  32.08 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  29.93 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  29.38 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  30.58 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  29.25 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  29.49 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  29.25 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  29.02 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  29.39 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  29.39 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.18 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  31.49 
 
 		 345 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.15 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  29.6 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  27.16 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  27.16 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  27.52 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.05 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  28.71 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  28.01 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2393  transport system permease protein  27.01 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  30.23 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  29.35 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  29.31 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  32.74 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>