More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3220 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  98.41 
 
 		 315 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  81.32 
 
 		 274 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  57.14 
 
 		 325 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  56.27 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  52.68 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  52.68 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  54.39 
 
 		 335 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  52.17 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  46.18 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  46.18 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  46.18 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  50.74 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  51.94 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  52.17 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  48.06 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  54 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  49.04 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  48.45 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  50.67 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  55.08 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  50 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  45.33 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  51.53 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.63 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  50.68 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  42.41 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  39.45 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  37.91 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  37.91 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  38.74 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  40.34 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  39.29 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.37 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  39.09 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38.96 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.87 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  41.04 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  39.75 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  37.18 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.84 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  41.72 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  37.25 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  38 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  37.59 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  37.59 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  36.91 
 
 		 338 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 282 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.15 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  34.5 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  48.65 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  35.57 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.09 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  29.47 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  31.13 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  29.47 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  32.39 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.47 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  33.56 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  28.34 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  34.48 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  34.48 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.15 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  34.48 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  32.78 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  32.81 
 
 		 452 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.97 
 
 		 694 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.61 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  33.11 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  28.71 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  33.12 
 
 		 351 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  31.6 
 
 		 359 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  30.49 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  34.89 
 
 		 354 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  32.06 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  35.43 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  30.95 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  35.25 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  31.8 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  31.38 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  34.39 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  28.57 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  29.7 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  31.58 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>