More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3669 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  97.44 
 
 		 313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  97.44 
 
 		 313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  62.54 
 
 		 313 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  63.45 
 
 		 313 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  58.94 
 
 		 314 aa  361  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.73 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  41.28 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  40 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  42.42 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  40.67 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  38.05 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 		 320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 		 320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.33 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.54 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  38.49 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  38.49 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  38.36 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  38.54 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  38.54 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  40.96 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  36.12 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  36.12 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  36.6 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  36.6 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  39.34 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  35.56 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  35.25 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  36.3 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  40.8 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.64 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  35.19 
 
 		 338 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 338 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  34.44 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  34.07 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  38.65 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  36.24 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.14 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  37 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  36.99 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  36.59 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  36.01 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  34.69 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  39.04 
 
 		 368 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  36 
 
 		 352 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  34.83 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.98 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  36.15 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  40.86 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  41.27 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.37 
 
 		 694 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  30.4 
 
 		 335 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  27.49 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  30.66 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  30.66 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  30.6 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  29.17 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  27.53 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  27.87 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  27.18 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  30.31 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  30.63 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  26.22 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  27.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  27.05 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  26.98 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  27.72 
 
 		 351 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  29.03 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  28.67 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  28.12 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  27.92 
 
 		 354 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  32.2 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  28.33 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  28.82 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  27.99 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  28.33 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  27.99 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  28.33 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>