More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3786 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  100 
 
 
335 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  70.76 
 
 
346 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  65.55 
 
 
320 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  65.55 
 
 
320 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  62.75 
 
 
320 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  60.78 
 
 
336 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  60.58 
 
 
318 aa  332  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  59.32 
 
 
328 aa  331  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  55.45 
 
 
319 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  55.45 
 
 
319 aa  328  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  55.45 
 
 
319 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  55.77 
 
 
319 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  57.72 
 
 
319 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  51.69 
 
 
318 aa  312  5.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  53.72 
 
 
325 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  55.05 
 
 
344 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  56.45 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  51.52 
 
 
349 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  57.14 
 
 
344 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  47.21 
 
 
312 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  52.36 
 
 
325 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  49.66 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  40 
 
 
322 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
322 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  44.78 
 
 
311 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.97 
 
 
336 aa  278  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  51.84 
 
 
352 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  48.99 
 
 
352 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  43.2 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  46.47 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  43.2 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  43.77 
 
 
320 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  41.47 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  41.61 
 
 
338 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  43.86 
 
 
289 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  42.28 
 
 
336 aa  268  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  41.61 
 
 
338 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 
338 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 
324 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  54.23 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  49.33 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  43.1 
 
 
337 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  41.58 
 
 
338 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 
338 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  41.78 
 
 
334 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  41.78 
 
 
338 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
320 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 
313 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  41.69 
 
 
313 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  42.75 
 
 
282 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
280 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  42.48 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  56.59 
 
 
274 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 
280 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  52.82 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  37.99 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  37.66 
 
 
313 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  37.66 
 
 
313 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  41.23 
 
 
278 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  41.25 
 
 
314 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  45.97 
 
 
332 aa  242  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  49.43 
 
 
325 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.67 
 
 
317 aa  215  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  29.65 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  28.85 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  28.71 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  33.8 
 
 
354 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  30.67 
 
 
349 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  29.7 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  28.31 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  31.37 
 
 
340 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.1 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  31.12 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  28.72 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  28.72 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  28.38 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  28.38 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  32.79 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  28.38 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  28.25 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  28.25 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  28.33 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  31.69 
 
 
367 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  26.49 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  29.25 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  27.44 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  30.58 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  27.03 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  28.39 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  31.96 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>