More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4397 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  100 
 
 		 325 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  87.08 
 
 		 325 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  56.15 
 
 		 320 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  56.15 
 
 		 320 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  56.29 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  53.72 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  54.95 
 
 		 318 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  49.52 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  49.52 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  49.52 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  57.6 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  53.77 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  52.66 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  56.89 
 
 		 315 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  49.04 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  49.36 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  46.26 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  43.93 
 
 		 368 aa  261  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  47.62 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  49.48 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  53.9 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  49.13 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  57.59 
 
 		 274 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  47.97 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  40.07 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  40.07 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.9 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.36 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  37.77 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  42.32 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  43.09 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  39.47 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  48.29 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  39.58 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  39.93 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  38.89 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  38.8 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  39.66 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  38.98 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  39 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  39.06 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  35.45 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  38.75 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  38.75 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  38.98 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  35.12 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  35.12 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  45.45 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  36.09 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.52 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  37.42 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 		 280 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.5 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  31.07 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  31.47 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  30.08 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.28 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.8 
 
 		 335 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  29.02 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.94 
 
 		 694 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  33.22 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  31.67 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  29.74 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  29.74 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0450  iron compound ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  32.48 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  31.94 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0322  ferrichrome transport system permease  29.41 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  32.12 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  30.26 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  32.17 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0397  iron compound ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  32.39 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4921  iron compound ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.406159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1048  transport system permease protein  29.65 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  32.06 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  29.08 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  30.33 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>