More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1048 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1048  transport system permease protein  100 
 
 
335 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  59.94 
 
 
336 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  60.79 
 
 
338 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  59.57 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0397  iron compound ABC transporter, permease protein  59.94 
 
 
346 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4921  iron compound ABC transporter, permease protein  59.88 
 
 
346 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.406159  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  59.57 
 
 
338 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0322  ferrichrome transport system permease  59.57 
 
 
338 aa  360  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  59.57 
 
 
346 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0450  iron compound ABC transporter, permease protein  59.27 
 
 
346 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  59.27 
 
 
338 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  59.27 
 
 
338 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
351 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
351 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
351 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  46.89 
 
 
351 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 
351 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  46.89 
 
 
351 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  46.89 
 
 
351 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  46.58 
 
 
351 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  45.96 
 
 
350 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  48.53 
 
 
349 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  41.25 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  41.25 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1812  transport system permease protein  51.3 
 
 
350 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.685396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  39.58 
 
 
344 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 
344 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  39.58 
 
 
344 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  39.58 
 
 
344 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  39.58 
 
 
344 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  38.76 
 
 
344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  37.11 
 
 
335 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
335 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  38.36 
 
 
335 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.76 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  38.03 
 
 
335 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
298 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  41.75 
 
 
337 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  37.7 
 
 
335 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  37.7 
 
 
335 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  38.36 
 
 
335 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
335 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
335 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1394  iron compound ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 
341 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.591622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  42.48 
 
 
322 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  42.16 
 
 
322 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  41.91 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5232  ABC transporter permease, C-terminal  48.1 
 
 
216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  40.32 
 
 
333 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  39.81 
 
 
333 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  40.44 
 
 
333 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  36.06 
 
 
336 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
334 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  34.64 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  34.64 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  34.64 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
334 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  36.58 
 
 
332 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  34.34 
 
 
340 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  39.42 
 
 
326 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 
343 aa  193  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  39.02 
 
 
350 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  38.82 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
334 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  35.87 
 
 
334 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
334 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
334 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  40.07 
 
 
342 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  36.59 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  40.27 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  36.76 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  32.09 
 
 
328 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  36.59 
 
 
347 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  32.12 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  32.9 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  32.12 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  37.7 
 
 
340 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  40.13 
 
 
335 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  35.69 
 
 
333 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  38.33 
 
 
347 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  38.17 
 
 
340 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  38.65 
 
 
347 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
325 aa  175  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  36.11 
 
 
338 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  37.01 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  36.39 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  36.51 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  32.93 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 
327 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  32.23 
 
 
327 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
366 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  32.23 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  32.23 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.5 
 
 
371 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>