More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0808 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  100 
 
 		 337 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  98.81 
 
 		 337 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  46.59 
 
 		 351 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  46.87 
 
 		 351 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  46.29 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  46.29 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  45.99 
 
 		 350 aa  291  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  46.13 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  41.49 
 
 		 335 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  42.2 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  42.68 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  40.6 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  40.6 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  42.51 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  42.64 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  42.64 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  42.94 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  41.72 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  41.72 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  41.72 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  41.41 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1048  transport system permease protein  40.23 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  39.08 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  39.08 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  38.32 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  43.24 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  37.18 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  37.18 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0450  iron compound ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  37.18 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4921  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.406159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0397  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  40.19 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  37.3 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0322  ferrichrome transport system permease  36.86 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  40.19 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5232  ABC transporter permease, C-terminal  49.53 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1812  transport system permease protein  45.51 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.685396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  42.26 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  36.34 
 
 		 336 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  36.83 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  38.8 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  37.17 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  37.17 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  36.34 
 
 		 329 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  36.87 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.69 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  37.17 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  40.12 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  40.12 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  36.22 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  34.02 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  35.67 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1394  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.591622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 		 334 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.34 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  38.04 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  35.69 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  33.04 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  33.94 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.23 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  32.06 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  34.13 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  37.39 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.76 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  36.13 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  32.48 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  32.69 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  35.15 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.88 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  35.15 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  35.6 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  33.55 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  33.87 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.01 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  33.54 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.94 
 
 		 678 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  37.78 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  37.85 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.26 
 
 		 678 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.43 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>