More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0635 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  100 
 
 		 320 aa  618  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  61.95 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  62.54 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  62.46 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  62.1 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  61.78 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  62.54 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  62.54 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  62.87 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  61.78 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  63.9 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  64.36 
 
 		 280 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  65.17 
 
 		 280 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  56.01 
 
 		 336 aa  329  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  52.35 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.96 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  50.99 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  47.12 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  47.12 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  50.87 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  43.93 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  43.97 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  43.73 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  46.38 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  42.77 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  41.34 
 
 		 349 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  39.62 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.94 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  37.5 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  37.5 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  39.86 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  39.25 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  39.43 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  38.94 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  37.99 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  39.59 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  42.38 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  40.36 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  38.03 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  40.07 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  34.69 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  36.09 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  34.43 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  35.03 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  35.29 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  35.35 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  35.34 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  36.71 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.76 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  37.36 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  40.47 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  31.89 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  37.36 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  31.53 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  29.14 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  29.14 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  31.97 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  29.21 
 
 		 375 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  27.88 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  27.58 
 
 		 335 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  27.58 
 
 		 335 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 343 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  31.37 
 
 		 371 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  26.74 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  26.74 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  29.37 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  27.54 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  30.66 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  27.54 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  30.36 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  30.85 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  29.55 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  30.5 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  30.5 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  30.5 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  30.5 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  28.65 
 
 		 368 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  28.52 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  30.51 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  30.51 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  30.51 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  26.64 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  26.64 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  26.64 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  30.85 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  26.79 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>