213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0025 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006663  SEA0025  resolvase, putative  100 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2201  resolvase  37.57 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  31.15 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  31.52 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  31.52 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  31.18 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  29.67 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  31.18 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  30.32 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  30.27 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.96 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  29.63 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  31.61 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  28.48 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  31.85 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  29.63 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  29.63 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  29.63 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  29.47 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  28.04 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.02 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  28.26 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  26.2 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  27.37 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  27.47 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  28.89 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  29.28 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  27.22 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  27.23 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  24.46 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  27.42 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.27 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  26.78 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  26.88 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  26.88 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  26.2 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  28.96 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.49 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  22.87 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  29.79 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  28.8 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0212  resolvase  45 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  22.87 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  22.87 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  24.47 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  24.47 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0151  resolvase  39.71 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  27.66 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  28.18 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  26.78 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25.26 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  24.46 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  27.47 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  26.49 
 
 		 309 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  26.78 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  25 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  26.86 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  25.27 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  25.38 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  22.83 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  24.06 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  26.11 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  23.94 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  27.96 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  24.14 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  22.34 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  30.26 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  28.03 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  26.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  26.23 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  21.74 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>