257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1264 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1264  L-lactate permease  100 
 
 		 453 aa  797    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.626342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0268  L-lactate permease  31.32 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000216096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4044  putative L-lactate permease  26.22 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1152  L-lactate permease  25.89 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1365  L-lactate permease  26.05 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1300  putative L-lactate permease  26 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1401  putative L-lactate permease  25.79 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1139  L-lactate permease  25.95 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0951  L-lactate permease  27.16 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1324  putative L-lactate permease  25.74 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000737543 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1145  L-lactate permease  25.74 
 
 		 499 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1165  L-lactate permease  25.53 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1256  L-lactate permease  25.53 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1578  L-lactate permease  37.4 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  29.14 
 
 		 506 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  27.14 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  31.34 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  27.97 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21870  hypothetical protein  31 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0912287  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  24.24 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  25.46 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  26.42 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  27.31 
 
 		 620 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  29.92 
 
 		 494 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  30.45 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  25.28 
 
 		 545 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.09 
 
 		 507 aa  93.6  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2811  L-lactate permease  26.19 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  25.18 
 
 		 564 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  25.35 
 
 		 543 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  29.18 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  26.22 
 
 		 556 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  26.22 
 
 		 556 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  26.22 
 
 		 556 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  25.67 
 
 		 589 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  25.28 
 
 		 553 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  25.92 
 
 		 545 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.44 
 
 		 556 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  24.73 
 
 		 568 aa  86.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  25.56 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  25.63 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  26.56 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  23.39 
 
 		 560 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  22.84 
 
 		 515 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  27.12 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  24.19 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  22.96 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  24.15 
 
 		 592 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  24.59 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  22.96 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  26.14 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  26.05 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  25.28 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  25.48 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  23.9 
 
 		 507 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  24.76 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  25.06 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  25.24 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  25.42 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  25 
 
 		 531 aa  76.6  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  25.6 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  25.6 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  25.6 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  25.6 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  24.88 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  25.36 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  37.32 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  39.85 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  26.16 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1957  L-lactate permease  23.13 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  25.73 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  40.78 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  35.53 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  39.2 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  25.12 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1203  hypothetical protein  31.83 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  39.2 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  30.34 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  38.33 
 
 		 564 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  34.87 
 
 		 570 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  32 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  25.96 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  27.27 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2853  sugar transporter  24.37 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.204872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  25.56 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  23.36 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  38.4 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  38.4 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  38.39 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  35.4 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  38.79 
 
 		 564 aa  70.1  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  31.33 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  37.5 
 
 		 562 aa  69.7  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  22.84 
 
 		 539 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  25.23 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  32.76 
 
 		 563 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>