264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0268 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0268  L-lactate permease  100 
 
 
498 aa  974    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000216096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1365  L-lactate permease  43.29 
 
 
499 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1152  L-lactate permease  44.33 
 
 
499 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0951  L-lactate permease  44.47 
 
 
497 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1165  L-lactate permease  42.97 
 
 
499 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1145  L-lactate permease  43.17 
 
 
499 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1401  putative L-lactate permease  43.8 
 
 
499 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1139  L-lactate permease  43.09 
 
 
499 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1324  putative L-lactate permease  43.17 
 
 
499 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000737543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1256  L-lactate permease  42.97 
 
 
499 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1300  putative L-lactate permease  43.6 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4044  putative L-lactate permease  43.39 
 
 
499 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1578  L-lactate permease  33.7 
 
 
474 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  28.11 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  24.9 
 
 
576 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  27.02 
 
 
547 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21870  hypothetical protein  25.63 
 
 
485 aa  123  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0912287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  25.64 
 
 
570 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  22.95 
 
 
576 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  26.63 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2390  L-lactate transport  26.37 
 
 
532 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  26.57 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2436  L-lactate transport  26.37 
 
 
532 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1203  hypothetical protein  26.44 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.05 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2811  L-lactate permease  25.21 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.05 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.05 
 
 
551 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  25.83 
 
 
551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  27.19 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  26.52 
 
 
557 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  25.7 
 
 
547 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  26.57 
 
 
560 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  22.95 
 
 
566 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  23.14 
 
 
562 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  25.62 
 
 
533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  26.71 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  25.34 
 
 
532 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  25.14 
 
 
548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  25.14 
 
 
548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  24.95 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  26.26 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  26.26 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  26.26 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  26.26 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1957  L-lactate permease  24.67 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  26.08 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  22.14 
 
 
563 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0101  L-lactate transport  24.47 
 
 
530 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  22.14 
 
 
563 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  25.7 
 
 
547 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0097  L-lactate transport  24.47 
 
 
530 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  27.98 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  24.76 
 
 
553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  24.57 
 
 
566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  25.15 
 
 
553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  24.35 
 
 
566 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  28.25 
 
 
507 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  24.03 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  25.71 
 
 
561 aa  113  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  25.05 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1757  L-lactate permease, putative  22.41 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  26.61 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  25.49 
 
 
566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  25 
 
 
552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  25 
 
 
552 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  24.37 
 
 
592 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  25.1 
 
 
506 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  24.56 
 
 
553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  24.95 
 
 
552 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  24.95 
 
 
552 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  24.95 
 
 
552 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  24.95 
 
 
552 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  25.43 
 
 
573 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  25.95 
 
 
547 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  25.84 
 
 
545 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  24.76 
 
 
552 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.05 
 
 
556 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  25.22 
 
 
556 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  25.78 
 
 
551 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  23.23 
 
 
564 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  25.64 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  25.82 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  25.22 
 
 
556 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  25.64 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  25.64 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  25.64 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  25.22 
 
 
556 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  25.64 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  25.64 
 
 
560 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  23.02 
 
 
539 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  23.02 
 
 
539 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  23.47 
 
 
539 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  24.62 
 
 
564 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  26.47 
 
 
554 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  24.13 
 
 
551 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  24.45 
 
 
562 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  24.75 
 
 
610 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  23.91 
 
 
539 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  26.37 
 
 
585 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>