259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2853 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2853  sugar transporter  100 
 
 		 530 aa  1019    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.204872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1041  L-lactate permease  67.8 
 
 		 524 aa  670    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1347  L-lactate permease  52.36 
 
 		 528 aa  496  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  37.15 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  34.12 
 
 		 556 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  34.12 
 
 		 556 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  34.12 
 
 		 556 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  36.59 
 
 		 532 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  33.76 
 
 		 556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  34.71 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1446  L-lactate/H+ symporter  36.77 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.48388  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  34.22 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  33.63 
 
 		 557 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  33.33 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2673  L-lactate transport  36.61 
 
 		 532 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2534  L-lactate transport  35.2 
 
 		 546 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3147  L-lactate transport  35.2 
 
 		 546 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  35.46 
 
 		 546 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  33.04 
 
 		 562 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  32.86 
 
 		 566 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  32.45 
 
 		 570 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  32.02 
 
 		 545 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  32.98 
 
 		 569 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  34.23 
 
 		 560 aa  264  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3167  L-lactate transport  34.82 
 
 		 546 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95118  hitchhiker  0.00142104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  34.05 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  34.05 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  34.05 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  34.05 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  32.97 
 
 		 566 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  34.05 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  33.39 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  33.87 
 
 		 560 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3085  L-lactate transport  34.26 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103578  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  32.49 
 
 		 561 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  32.96 
 
 		 553 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3141  L-lactate transport  34.8 
 
 		 554 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000030121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  32.54 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  32.54 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  32.54 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6502  L-lactate transporter  34.64 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  32.54 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  31.5 
 
 		 553 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  32.12 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  32.48 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  32.54 
 
 		 552 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  32.36 
 
 		 552 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  32.12 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  33.02 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  33.4 
 
 		 554 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  32.04 
 
 		 547 aa  253  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  33.21 
 
 		 569 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  32.48 
 
 		 560 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  31.49 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  32.91 
 
 		 551 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  33.84 
 
 		 549 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  31.73 
 
 		 543 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  30.47 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  32.01 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  30.47 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  30.28 
 
 		 551 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  32.01 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  32.01 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  30.28 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  32.01 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  30.28 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  34.97 
 
 		 575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  30.28 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  32.01 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  32.01 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  31.98 
 
 		 553 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  31.13 
 
 		 573 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  32.32 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  31.98 
 
 		 553 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  31.83 
 
 		 566 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  33.21 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  31.89 
 
 		 545 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  31.59 
 
 		 539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  31.8 
 
 		 552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  32.04 
 
 		 533 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  30.89 
 
 		 589 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  30.76 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  30.39 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  30.26 
 
 		 539 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  31.51 
 
 		 558 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  31.17 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  29.74 
 
 		 560 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  29.74 
 
 		 565 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  29.63 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  29.94 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  29.94 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  30.44 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  30.44 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  30.44 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  30.44 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  31.67 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  28.81 
 
 		 560 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  30.83 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  30.47 
 
 		 539 aa  223  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  28.91 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>