262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1347 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1347  L-lactate permease  100 
 
 		 528 aa  1020    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2853  sugar transporter  52.36 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.204872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1041  L-lactate permease  49.71 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  33.77 
 
 		 540 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  32.9 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  31.27 
 
 		 592 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  31.68 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  31.55 
 
 		 552 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  31.36 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  31.36 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  31.36 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  31.36 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  31.05 
 
 		 553 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  30.26 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  31.17 
 
 		 552 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  31.36 
 
 		 552 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  31.19 
 
 		 553 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  32.27 
 
 		 532 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2673  L-lactate transport  33.05 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  30.14 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  31.96 
 
 		 560 aa  240  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  30.99 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  30.45 
 
 		 566 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  30.71 
 
 		 556 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  30.71 
 
 		 556 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  30.77 
 
 		 556 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  30.71 
 
 		 556 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  30.26 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  32.65 
 
 		 547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  31.6 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  31.6 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  31.6 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  31.6 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  31.6 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  31.6 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  31.18 
 
 		 569 aa  233  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  31.41 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  31.04 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1446  L-lactate/H+ symporter  31.79 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.48388  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  30.41 
 
 		 560 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  29.94 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  31.71 
 
 		 552 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  30.36 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  30.41 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  32.09 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  30.19 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  30.74 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  34.14 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  30.78 
 
 		 563 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  30.78 
 
 		 563 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  30 
 
 		 572 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  30 
 
 		 572 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  30 
 
 		 572 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3141  L-lactate transport  31.87 
 
 		 554 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000030121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  30 
 
 		 572 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2534  L-lactate transport  31.56 
 
 		 546 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3147  L-lactate transport  31.56 
 
 		 546 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  30 
 
 		 572 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6502  L-lactate transporter  32.29 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3085  L-lactate transport  32.09 
 
 		 546 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103578  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3167  L-lactate transport  31.36 
 
 		 546 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95118  hitchhiker  0.00142104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  30.65 
 
 		 564 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  30.15 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  30.15 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  30.15 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  30.15 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  29.64 
 
 		 576 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  30.13 
 
 		 589 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  30.49 
 
 		 569 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  31.76 
 
 		 554 aa  217  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  30.88 
 
 		 552 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  30.77 
 
 		 548 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  30.15 
 
 		 552 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  31.1 
 
 		 557 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  30.35 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  30.21 
 
 		 566 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  29.43 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  30.28 
 
 		 586 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  28.57 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  28.76 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  28.76 
 
 		 565 aa  211  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  30.33 
 
 		 543 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  30.83 
 
 		 533 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  29.37 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  29.79 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  30.47 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  28.63 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  29.8 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  31.01 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  29.8 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  30.34 
 
 		 551 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  30.05 
 
 		 545 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  30.63 
 
 		 562 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  29.01 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  31.54 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  32.17 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  32.06 
 
 		 553 aa  203  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.771798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  29.96 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  29.96 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  29.96 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>