220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1578 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1578  L-lactate permease  100 
 
 		 474 aa  887    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0268  L-lactate permease  33.26 
 
 		 498 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000216096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1152  L-lactate permease  29.93 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21870  hypothetical protein  35.87 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0912287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1300  putative L-lactate permease  29.93 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4044  putative L-lactate permease  29.68 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1365  L-lactate permease  29.68 
 
 		 499 aa  176  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1324  putative L-lactate permease  29.93 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000737543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1401  putative L-lactate permease  29.43 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1145  L-lactate permease  29.93 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1139  L-lactate permease  29.8 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1165  L-lactate permease  29.8 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1256  L-lactate permease  29.8 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0951  L-lactate permease  27.97 
 
 		 497 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1203  hypothetical protein  31.65 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  30.05 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1264  L-lactate permease  43.1 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.626342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  27.72 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3085  L-lactate transport  27.94 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103578  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  26.48 
 
 		 592 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  22.22 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  25.79 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  25.77 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6502  L-lactate transporter  27.53 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2534  L-lactate transport  27.97 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3147  L-lactate transport  27.97 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3167  L-lactate transport  27.97 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95118  hitchhiker  0.00142104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  22.5 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  24.65 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  24.76 
 
 		 545 aa  67  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  24.83 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  24.33 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  26.74 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  24.83 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  25.49 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  25.06 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  25.69 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  24.24 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2853  sugar transporter  24.88 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.204872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2811  L-lactate permease  22.22 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  26.29 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  23.3 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  24.54 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  22.2 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  26.05 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  30.7 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  36.03 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  23.77 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  28.34 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1957  L-lactate permease  22.94 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  29.68 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  22.35 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  21.46 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  21.46 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  29.33 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  29.33 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  29.33 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  29.33 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  29.33 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1347  L-lactate permease  24.29 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  31.9 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  30.07 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  39.6 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  31.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  31.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  31.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  31.69 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  28.67 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  31.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  31.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  31.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  26.42 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  20.75 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  25.25 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  28.67 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  25.25 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  33.56 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  28 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  36.89 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  36.89 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1147  L-lactate permease family protein, putative  25.38 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  26.57 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  25.8 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  38.37 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2390  L-lactate transport  22.87 
 
 		 532 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2436  L-lactate transport  22.87 
 
 		 532 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  28.39 
 
 		 570 aa  57  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  28.87 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  30.67 
 
 		 570 aa  57  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  24.81 
 
 		 589 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  28.76 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  29.03 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  29.63 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  29.03 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  21.72 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  29.03 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  29.03 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.69 
 
 		 538 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  33.11 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  29.13 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>