245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1147 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1147  L-lactate permease family protein, putative  100 
 
 
517 aa  1016    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0574  L-lactate permease family protein  82.75 
 
 
516 aa  853    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2514  L-lactate permease family protein, putative  42.77 
 
 
525 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1757  L-lactate permease, putative  39.88 
 
 
531 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2355  L-lactate permease-like protein  41.41 
 
 
521 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0100386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0226  L-lactate permease, putative  44.29 
 
 
542 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0708  L-lactate permease, putative  36.55 
 
 
527 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1445  L-lactate permease, putative  36.89 
 
 
525 aa  294  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.168735  hitchhiker  0.00404286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0951  L-lactate permease  23.8 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1139  L-lactate permease  22.67 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1152  L-lactate permease  23.94 
 
 
499 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1401  putative L-lactate permease  23.58 
 
 
499 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1300  putative L-lactate permease  24.04 
 
 
499 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1365  L-lactate permease  23.53 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1324  putative L-lactate permease  23.53 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000737543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1165  L-lactate permease  22.41 
 
 
499 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4044  putative L-lactate permease  23.33 
 
 
499 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1256  L-lactate permease  22.41 
 
 
499 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  25.05 
 
 
547 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1145  L-lactate permease  23.12 
 
 
499 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  24.6 
 
 
564 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  25.97 
 
 
552 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  24.38 
 
 
556 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  24.24 
 
 
556 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  24.06 
 
 
556 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  24.24 
 
 
556 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  25.4 
 
 
561 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  24.73 
 
 
556 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2879  L-lactate permease-like  24.76 
 
 
499 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  24.86 
 
 
589 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  24.25 
 
 
573 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  22.32 
 
 
553 aa  97.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  22.3 
 
 
545 aa  96.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  25.05 
 
 
560 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  24.86 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  24.86 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  24.86 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  22.63 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  22.63 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  22.63 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  24.86 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  22.63 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  24.86 
 
 
560 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  25.05 
 
 
560 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  24.43 
 
 
570 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  22.47 
 
 
552 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  23.35 
 
 
553 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  23.19 
 
 
551 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  22.98 
 
 
553 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  23.19 
 
 
551 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  23.5 
 
 
552 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  23.13 
 
 
551 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  22.18 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  24.11 
 
 
566 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  23.5 
 
 
552 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  23.13 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  23.29 
 
 
560 aa  91.3  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  23.75 
 
 
566 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  25.04 
 
 
572 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  25.04 
 
 
572 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  25.04 
 
 
572 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  25.4 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  21.69 
 
 
553 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  25.52 
 
 
572 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  25.4 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2189  L-lactate transport  22.98 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.5401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  22.16 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  22.85 
 
 
551 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0097  L-lactate transport  23.21 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0101  L-lactate transport  23.21 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  22.1 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  21.75 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  23.96 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  23.53 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  21.5 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  21.01 
 
 
539 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  21.01 
 
 
539 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  22.53 
 
 
552 aa  84  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  22.26 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  21.72 
 
 
565 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  22.82 
 
 
541 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  21.72 
 
 
560 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  23.22 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  21.25 
 
 
515 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  21.91 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  23.22 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0268  L-lactate permease  24.4 
 
 
498 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000216096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  23.22 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  21.72 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  21.91 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  22.43 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  21.72 
 
 
539 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  23.53 
 
 
564 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  22.2 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>