76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1614 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  100 
 
 		 193 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  98.96 
 
 		 193 aa  366  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  91.71 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  78.4 
 
 		 192 aa  258  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  69.94 
 
 		 188 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  69.75 
 
 		 191 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  69.33 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  69.75 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  69.33 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  69.75 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  69.75 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  69.75 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  69.75 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  69.75 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  69.75 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  69.33 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  69.33 
 
 		 194 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  69.33 
 
 		 188 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  68.71 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  68.71 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  68.1 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  67.48 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  60.69 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  61.93 
 
 		 180 aa  205  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  59.54 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  59.44 
 
 		 182 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  61.73 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  67.07 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  64.81 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  64.2 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  61.49 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  63.19 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  54.49 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  55 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  46.52 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  47.62 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  47.06 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  52.6 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  47.53 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  42.5 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  52.2 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  48.61 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  42.24 
 
 		 173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  43.31 
 
 		 174 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  48.43 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  43.4 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  47.09 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  40.57 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  38.55 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  37.43 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  38.06 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  36.65 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  42.68 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  35.48 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  38.29 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  38.86 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  38.86 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  38.86 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  34.15 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  34.06 
 
 		 163 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  36.59 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  33.33 
 
 		 169 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  36.6 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  34.06 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  35.38 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  35.38 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  36.51 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  37.5 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  28.5 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  25.49 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0319  phasin  30.61 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1874  phasin  31.96 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  26.49 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5545  phasin family protein  28.26 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0800573  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1084  hypothetical protein  62.5 
 
 		 44 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158964  normal  0.794505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  27.05 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>