76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2588 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  100 
 
 		 190 aa  367  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  98.42 
 
 		 190 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  90.91 
 
 		 194 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  82.54 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  82.54 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  82.54 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  82.54 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  82.54 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  82.54 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  82.54 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  84.85 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  84.85 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  85.98 
 
 		 191 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  84.85 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  84.85 
 
 		 188 aa  284  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  84.85 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  83.64 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  83.64 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  74.07 
 
 		 192 aa  243  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  68.71 
 
 		 193 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  68.71 
 
 		 193 aa  227  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  68.1 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  57.3 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  54.84 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  56.82 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  56.73 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  62.58 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  59.63 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  61.73 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  61.73 
 
 		 187 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  58.64 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  55.69 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  53.93 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  56.17 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  58.54 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  55.41 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  50.6 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  46.25 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  48.47 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  47.02 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  47.83 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  43.9 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  44.17 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  52.17 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  51.57 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  52.8 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  40.99 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  41.38 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  36.56 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  46.24 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  40.13 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  45 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  36.65 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  35.09 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  39.02 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  36.72 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  35.59 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  36.72 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  36.72 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  36.02 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  41.33 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  36.02 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  36.02 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  36.81 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  40.79 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  32.85 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  32.12 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  27.74 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  31.07 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5545  phasin family protein  34.74 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0800573  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1874  phasin  38.46 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  25 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  29.93 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0319  phasin  32.04 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  30.25 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1084  hypothetical protein  65.62 
 
 		 44 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158964  normal  0.794505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>