71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0875 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  100 
 
 
188 aa  357  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  72.83 
 
 
187 aa  209  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  58.01 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  59.63 
 
 
178 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  51.55 
 
 
190 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  51.55 
 
 
188 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  50.93 
 
 
188 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  52.8 
 
 
191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  52.8 
 
 
191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  50.93 
 
 
188 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  52.8 
 
 
191 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  52.8 
 
 
191 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  50.93 
 
 
190 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  52.8 
 
 
191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  52.47 
 
 
191 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  52.47 
 
 
189 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  50.93 
 
 
188 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  52.47 
 
 
189 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  45.4 
 
 
182 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  50.31 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  50.31 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  50.31 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  51.55 
 
 
192 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  48.45 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  51.5 
 
 
187 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  46.07 
 
 
180 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  48.45 
 
 
193 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  48.45 
 
 
187 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  48.45 
 
 
187 aa  148  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  48.45 
 
 
193 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  47.83 
 
 
193 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  43.48 
 
 
192 aa  144  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  46.58 
 
 
182 aa  141  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  45.41 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  46.06 
 
 
197 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  42.7 
 
 
180 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  58.39 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  43.71 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  49.39 
 
 
181 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  51.74 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  41.77 
 
 
185 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  39.77 
 
 
181 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  41.07 
 
 
174 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  44.1 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  48.61 
 
 
187 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  38.37 
 
 
173 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  37.27 
 
 
174 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  36.36 
 
 
181 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  34.68 
 
 
188 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  40.76 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  39.58 
 
 
181 aa  98.2  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  39.08 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  32.95 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  33.73 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  30 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  30.65 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  30.2 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  31.97 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  33.83 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  30.05 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  26.62 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  30.23 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  30.23 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  30.23 
 
 
194 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  25.35 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  29.07 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  23.4 
 
 
169 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  23.19 
 
 
169 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  30.23 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  30.23 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5545  phasin family protein  26.8 
 
 
160 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0800573  normal  0.461059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>