52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2522 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  100 
 
 		 168 aa  333  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  30.52 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  27.63 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  26.97 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  26.8 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  27.63 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  26.32 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  26.32 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  26.32 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  30.2 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  26.32 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  26.32 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  30.13 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  29.85 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  25.66 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  25.66 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  25.66 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  25.66 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  25.66 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  25.66 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  25.66 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  25.66 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  26.32 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  25.49 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  25.49 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  25.66 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  25 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  27.7 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  26.85 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  26.95 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  25.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  28 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  26 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  22.37 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  27.27 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  26.67 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  27.74 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  26 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  25.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  26.35 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  24.82 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  24.84 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  25.95 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  23.03 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  23.03 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  26.38 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  21.66 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  27.92 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  24.84 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  24.2 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  20.69 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  22.73 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>