54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0319 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0319  phasin  100 
 
 		 170 aa  346  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  32.23 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  36.15 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  30.95 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  30.95 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  28.67 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  34.38 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  33.01 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  33.01 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  33.01 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  33.01 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  33.01 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  33.01 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  33.01 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  33.01 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  33.01 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  41.33 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  32.04 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  32.04 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  32.04 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  32.04 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  32.04 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  32.04 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  32.04 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  32.04 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  30.28 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  32.31 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  31.54 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  32.38 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  36 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  28.81 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  28.16 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  33.02 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4762  phasin family protein  27.41 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883457  normal  0.241992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  30.68 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  27.97 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  32.73 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  31.43 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  28.09 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  36.84 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  35.9 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  32 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  30.1 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  30 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  27.27 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  28.21 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  32 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  34.15 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  30.11 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  32.26 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  32.26 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  29.03 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>