74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1992 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  100 
 
 		 187 aa  355  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  60.62 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  60.62 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  60 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  60 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  60 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  60 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  60 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  60 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  60 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  60 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  58.75 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  60 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  60 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  60 
 
 		 191 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  60 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  60 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  55.49 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  57.5 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  58.28 
 
 		 192 aa  177  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  56.25 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  52.57 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  53.99 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  59.76 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  55 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  54.44 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  57.67 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  54.66 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  54.04 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  57.06 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  49.72 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  52.17 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  56.29 
 
 		 183 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  57.89 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  46.24 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  46.01 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  44.17 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  45.93 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  43.89 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  45.62 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  45.2 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  50.28 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  42.33 
 
 		 178 aa  131  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  44.2 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  38.67 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  44.9 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  44.08 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  45.61 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  36.26 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  36.94 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  39.74 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  44.81 
 
 		 170 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  37.93 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  35.1 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  34.87 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  35.62 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  40.26 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  37.65 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  37.65 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  37.65 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  39.34 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  39.34 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  38.15 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  36.05 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  34.62 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  28.57 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  29.65 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  27.82 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  28.81 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  26.32 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  27.98 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0319  phasin  27.97 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1530  hypothetical protein  25.42 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5545  phasin family protein  24.44 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0800573  normal  0.461059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>