11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1530 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1530  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1394  hypothetical protein  80.39 
 
 		 155 aa  252  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.887957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0874  hypothetical protein  40.65 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000363906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1408  hypothetical protein  37.97 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  27.53 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  26.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  28.21 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  30.08 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  22.56 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  24.83 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  25.84 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>