55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3861 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  100 
 
 
193 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  33.33 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  32 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  23.95 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  31.25 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  34.35 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  33.33 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  29.68 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  27.94 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  26.97 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  25.54 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  30.41 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  25.42 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  28.99 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  28.99 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  28.99 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  28.99 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  28.99 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  28.05 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  25.75 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  28.05 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  28.05 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  27.21 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  24.29 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  26.83 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  28.99 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  28.99 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  28.87 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  27.98 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  28.26 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  28.87 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  26.47 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  28.87 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  29.58 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  27.21 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  28.87 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  27.21 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  25.6 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  25.74 
 
 
193 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  28.87 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  26.79 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  26.81 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  24.26 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  26.47 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  29.71 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  25.61 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  27.61 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  27.94 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  27.52 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  27.07 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  26.47 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  23.36 
 
 
190 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  25 
 
 
185 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  27.16 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>