68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0542 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  78.53 
 
 
194 aa  257  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  78.76 
 
 
193 aa  257  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  78.76 
 
 
193 aa  257  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  80.23 
 
 
194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  80.79 
 
 
194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  80.23 
 
 
194 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  35.98 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  37.8 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  37.8 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  37.8 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  37.8 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  37.8 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  37.8 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  37.8 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  37.2 
 
 
188 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  37.2 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  36.59 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  36.59 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  36.59 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  36.59 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  36.59 
 
 
188 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  36.59 
 
 
188 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  36.59 
 
 
190 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  40.12 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  35.98 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  36.16 
 
 
180 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  36.65 
 
 
185 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  37.65 
 
 
193 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  37.65 
 
 
193 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  38.89 
 
 
193 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  34.46 
 
 
188 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  41.94 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  33.53 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  35.88 
 
 
180 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  33.9 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  32.28 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  34.97 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  35.03 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  37.11 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  34.34 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  31.1 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  30.12 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  34.78 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  35.44 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  32.02 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  31.95 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  35.22 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  32.08 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  33.54 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  35.12 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  29.45 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  28.17 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  27.54 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  27.04 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  24.43 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  31.58 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  30 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  30.99 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  28.36 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1530  hypothetical protein  25.73 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  26.95 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  25.14 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1394  hypothetical protein  24.48 
 
 
155 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.887957  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  25.2 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  29.21 
 
 
169 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  25.35 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  29.21 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>