16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1394 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.887957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1530  hypothetical protein  80.39 
 
 		 182 aa  234  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0874  hypothetical protein  45.32 
 
 		 191 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000363906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1408  hypothetical protein  44.6 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  33.09 
 
 		 194 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  25.69 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  25.4 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  25.81 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  31.18 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  25.55 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  28.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  29.07 
 
 		 182 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  29.07 
 
 		 187 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  23.81 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  29.07 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>