13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1408 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1408  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  331  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0874  hypothetical protein  85.56 
 
 		 191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000363906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  45.71 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1394  hypothetical protein  44.6 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.887957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1530  hypothetical protein  37.97 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  32.09 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  32.14 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  26.43 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  31.4 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  30.56 
 
 		 187 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  34.34 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  30.7 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  28.69 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>