72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2304 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2304  phasin  100 
 
 		 181 aa  347  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  53.76 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  52.81 
 
 		 180 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  55.83 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  51.69 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  60.54 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  51.12 
 
 		 180 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  48.9 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  50.87 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  50.92 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  51.53 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  53.99 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  51.25 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  51.25 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  51.25 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  51.25 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  51.25 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  51.25 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  53.37 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  51.25 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  51.88 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  51.25 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  54.49 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  51.25 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  51.25 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  51.25 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  51.25 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  51.25 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  51.25 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  50 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  49.38 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  49.38 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  48.12 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  47.5 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  45.62 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  43.11 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  44.64 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  43.37 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  47.48 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  37.42 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  36.72 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  36.65 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  36.88 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  40.65 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  32.96 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  40.13 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  34.18 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  36.13 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  41.52 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  36.48 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  37.57 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  31.29 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  34.36 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  30.43 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  32.77 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  33.53 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  33.53 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  38.35 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  27.21 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  29.41 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  33.33 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  33.53 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  33.53 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  29.41 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  36.81 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  31.54 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  31.54 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  30.41 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  27.57 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  24.82 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000363906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>