70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2692 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  89.89 
 
 		 194 aa  293  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  90.45 
 
 		 194 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  91.01 
 
 		 194 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  90.45 
 
 		 194 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  78.76 
 
 		 193 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  40.24 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  40.24 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  40.24 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  40.24 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  40.24 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  40.24 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  40.24 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  40.24 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  39.39 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  39.39 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  37.58 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  36.36 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  35.76 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  38.89 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  38.89 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  38.27 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  37.65 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  36.21 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  35.22 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  35.03 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  38.85 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  37.95 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  34.48 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  34.81 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  35.44 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  33.33 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  35.85 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  33.33 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  36.9 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  31.71 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  38.79 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  35.19 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  29.52 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  31.46 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  33.54 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  34.1 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  32.02 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  34.94 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  33.95 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  30.59 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  31.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  29.58 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  29.52 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  31.71 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  26.95 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  30.77 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  28.26 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  30.07 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  29.63 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  32.72 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  27.95 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  26.4 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  26.46 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  33.09 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  25.81 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  25.43 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  29.21 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>