74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0737 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  100 
 
 
184 aa  360  7.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  58.28 
 
 
192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  58.02 
 
 
188 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  58.02 
 
 
188 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  58.02 
 
 
188 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  58.02 
 
 
188 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  58.02 
 
 
188 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  57.41 
 
 
188 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  57.41 
 
 
188 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  56.79 
 
 
194 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  57.14 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  57.14 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  57.14 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  57.14 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  57.14 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  57.14 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  57.14 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  57.14 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  56.17 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  55.56 
 
 
190 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  54.94 
 
 
193 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  54.94 
 
 
193 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  53.7 
 
 
193 aa  174  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  53.05 
 
 
183 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  47.46 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  47.7 
 
 
182 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  49.39 
 
 
182 aa  157  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  46.15 
 
 
180 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  45.6 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  48.78 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  46.01 
 
 
192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  48.17 
 
 
187 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  42.39 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  46.01 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  42.44 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  50.31 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  41.72 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  40.33 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  39.2 
 
 
182 aa  124  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  45.58 
 
 
181 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  40.13 
 
 
174 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  36.54 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  43.09 
 
 
187 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  37.42 
 
 
174 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  44.37 
 
 
187 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  36.11 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  39.61 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  43.67 
 
 
188 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  34.16 
 
 
173 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  31.87 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  33.54 
 
 
197 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  30.06 
 
 
190 aa  87.8  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  32.69 
 
 
173 aa  87.8  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  31.36 
 
 
186 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  38.24 
 
 
178 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  39.31 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  37.01 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  29.38 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  30.81 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  29.38 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  29.38 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  30.4 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  30.4 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  29.12 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  29.38 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  24.82 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1085  phasin family protein  82.05 
 
 
51 aa  65.1  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0874212  normal  0.941576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  25.55 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1084  hypothetical protein  91.18 
 
 
44 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158964  normal  0.794505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  24.82 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  28.57 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  24.29 
 
 
193 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  23.03 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  25.96 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>