77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2171 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  100 
 
 		 188 aa  360  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  100 
 
 		 188 aa  360  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  97.34 
 
 		 188 aa  328  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  97.34 
 
 		 188 aa  328  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  97.34 
 
 		 188 aa  328  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  95.21 
 
 		 188 aa  324  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  95.21 
 
 		 188 aa  321  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  85.71 
 
 		 189 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  85.71 
 
 		 189 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  85.71 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  85.71 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  85.71 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  85.71 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  85.71 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  91.46 
 
 		 191 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  86.06 
 
 		 194 aa  285  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  84.24 
 
 		 190 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  83.64 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  74.69 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  69.33 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  68.71 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  68.71 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  59.78 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  57.78 
 
 		 180 aa  205  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  56.67 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  56.67 
 
 		 180 aa  201  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  61.73 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  60.87 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  62.96 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  62.96 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  64.42 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  57.93 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  54.29 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  59.88 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  62.8 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  54.78 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  46.25 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  48.88 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  50 
 
 		 174 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  47.62 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  44.51 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  46.58 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  44.38 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  42.24 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  50.62 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  42.53 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  52.8 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  47.92 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  36.67 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  46.2 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  38.71 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  37.43 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  37.27 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  42.54 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  38.29 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  38.32 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  38.29 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  38.29 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  38.29 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  37.42 
 
 		 172 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  36.36 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  36.36 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1848  phasin  42 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.32007e-26  decreased coverage  0.00809147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  34.07 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  31.16 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  32.61 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  32.61 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  40.65 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  31.08 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  26.32 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5545  phasin family protein  29.47 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0800573  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1874  phasin  35.05 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3861  phasin family protein  29.93 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0319  phasin  32.04 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  28.1 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1084  hypothetical protein  65.62 
 
 		 44 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158964  normal  0.794505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0874  hypothetical protein  29.88 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000363906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>